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生物種
- EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報 -

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生物種情報

名称 *1Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
宿主Homo sapiens (ヒト)
その他の名称 *1equivalent name: 2019-nCoV / COVID-19 ...2019-nCoV / COVID-19 / COVID19 / COVID-19 virus / HCoV-19 / Human coronavirus 2019 / SARS-2 / SARS2 / SARS-CoV2 / Wuhan coronavirus / その他: SARS-CoV-2
構造データでの名称Sars-cov-2 / 2019-nCoV
NCBI Taxonomy ID2697049
系統 *1ウイルス > リボウィリア > Orthornavirae > Pisuviricota > Pisoniviricetes > ニドウイルス目 > コロナウイルス科 > コロナウイルス科 > Orthocoronavirinae > Betacoronavirus > SARS関連コロナウイルス > SARSコロナウイルス
ウィキペディア
ウィキペディア - SARSコロナウイルス2: SARSコロナウイルス2(サーズコロナウイルスツー、英語: severe acute respiratory syndrome coronavirus 2、略称: SARS-CoV-2、中国語: 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2)は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19)の原因となる、SARS関連コロナウイルス (SARSr-CoV) に属するコロナウイルスである。日本の国家機関や主要な報道機関は「新型コロナウイルス」と呼んでおり、「新型コロナ」や「コロナ」と省略される場合もある...
External linkVirus-Host DB
コメントウイルス
出典*1: NCBI Taxonomy

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EMDB エントリ (344)

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PDB エントリ (1017)

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SASBDB エントリ (0)

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万見生物種について

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お知らせ

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2020年8月12日: New: 新型コロナ情報

New: 新型コロナ情報

  • 新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: New: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語"EMD-"は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:PDBeのEMDBサイト / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。詳細は下記のリンクをご覧ください。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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2017年6月16日: Omokage検索で絞り込み

Omokage検索で絞り込み

  • Omokage検索の結果をキーワードとデータベースの種類で絞り込むことができるようになりました。

関連情報:Omokage検索

すべてのお知らせ

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万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

  • EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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